Kuva: Metla/Erkki Oksanen

Tutkimustoiminta, jonka osuus Metlan kokonaisbudjetista on n. 85 %, rahoitetaan pääasiassa valtion budjettirahoilla.

Viime vuosina tutkimukseen käytetyn suoran budjettirahoituksen osuus on ollut n. 32 miljoonaa euroa, mikä on n. 80 % Metlan vuotuisesta budjettirahoituksesta.

Neljännes tutkimuksesta rahoitetaan ulkopuolisella rahoituksella.

Tärkeimmät yhteistyörahoittajat ovat EU, Suomen Akatemia, Tekes ja maa- ja metsätalousministeriö.